在整個毛細管氣相色譜中，柱子的安裝尤為重要，柱子安裝的好壞直接影響到檢測結果。因此，一根好的毛細管氣相色譜柱和設計得很好的色譜系統，還必須使柱子在系統中安裝得合理，才能做出好的結果。
    在毛細管氣相色譜柱連接到檢鍘器之前，先接通載氣.看一下柱子的出口是否有載氣通過，如果沒有載氣從柱子出來，說明柱前的系統中有的地方翻氣或柱子堵塞，應找出原因加以解決.然后將柱子的未端盡可能的伸到檢側器的噴嘴以下的1-2毫米處。并使柱子的出口處干氣流的zen高流速區域，如果柱子不能直接伸到檢測器的噴嘴下1-2毫米處，但必須伸到尾吹氣入口的上部使柱子的末端處于氣流的高速區域。
    近兩年毛細管氣相色譜柱的發展和趨向。氣相色譜柱制柱工藝是一個成熟的技術，所以在制柱工藝方面的研究不夠活躍。近年新研究的固定相集中在常溫離子液體和各種環糊精的衍生物。